Det finns några fler kommandon som är bra att ha när man skriver m-filer. T.ex. kan man radera alla existerande variabler i Matlab genom att skriva clear all. Detta kan med fördel göras i början på programmet man skriver, så att inte gamla variabler kan ställa till bekymmer i en ny beräkning.
Ett annat trick för att underlätta programmeringen är att skriva kommentarer om vad som sker på de olika raderna i en programkod. Detta är inte minst viktigt om någon annan än programeraren skall läsa koden. Kommentarer skrivs i Matlab m.h.a. procenttecknet %.
Säg t.ex. att vi vill beräkna medelvärdet av 
, 
och
. Ett kommenterat program för att göra detta kan t.ex. se ut
enligt nedan.
% erase any old variables clear all % data points a = 1; b = 2; c = 3; % compute mean value, m, of data m = (a+b+c)/3